Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM5Q9C035 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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