Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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FOXQ1Q9C009 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
FOXQ1Q9C009 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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