Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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