Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2E2Q96LR5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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