Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLDN22Q8N7P3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CLDN22Q8N7P3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CLDN22Q8N7P3 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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