Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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