Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 OR4D9-203ENST00000641962 6123 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms