Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK8P49336 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK8P49336 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms