Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF9P41273 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms