Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNA3P32297 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms