Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP1P29466 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP1P29466 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP1P29466 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.3 ms