Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2E1P29083 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms