Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms