Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC130P13994 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms