Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCF2LO15068 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MCF2LO15068 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms