Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms