Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F8A0AVK6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F8A0AVK6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.4 ms