Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
COPS3Q9UNS2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms