Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms