Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CELF4Q9BZC1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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