Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERCC4Q92889 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms