Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBXN4Q92575 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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