Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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CLIP4Q8N3C7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLIP4Q8N3C7 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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