Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CATSPER4Q7RTX7 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms