Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CCDC96Q2M329 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CCDC96Q2M329 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC96Q2M329 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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