Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SIX1Q15475 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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