Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NPRL3Q12980 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms