Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IFFO1Q0D2I5 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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