Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
FAM3AP98173 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms