Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TUBB4BP68371 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TUBB4BP68371 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms