Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRCP23327 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRCP23327 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRCP23327 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRCP23327 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRCP23327 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRCP23327 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HRCP23327 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HRCP23327 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HRCP23327 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HRCP23327 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HRCP23327 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254 ms