Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms