Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM228BP0C875 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms