Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMNAP02545 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMNAP02545 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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