Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCF2LO15068 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms