Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GOLGA6L4A6NEF3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms