Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT140Q96RY7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT140Q96RY7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms