Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TUBGCP5Q96RT8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms