Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHAMP1Q96JM3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHAMP1Q96JM3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms