Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms