Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
AGAP9Q5VTM2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AGAP9Q5VTM2 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms