Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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