Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CCNIQ14094 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms