Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AFMP43652 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AFMP43652 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AFMP43652 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms