Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSR1P43307 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSR1P43307 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR1P43307 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR1P43307 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR1P43307 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSR1P43307 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms