Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2E1P29083 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms