Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HLA-DMAP28067 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms