Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms