Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LRIT1Q9P2V4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LRIT1Q9P2V4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LRIT1Q9P2V4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LRIT1Q9P2V4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LRIT1Q9P2V4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LRIT1Q9P2V4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LRIT1Q9P2V4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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