Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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